23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5268 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  100 
 
 		 493 aa  1012    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  62.63 
 
 		 498 aa  597  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  62.42 
 
 		 498 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  61.26 
 
 		 528 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  50.1 
 
 		 510 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  48.63 
 
 		 545 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  34.98 
 
 		 643 aa  256  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  34.11 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  34.11 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  34.11 
 
 		 505 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  34.11 
 
 		 506 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  32.9 
 
 		 482 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  31.25 
 
 		 481 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  31.25 
 
 		 481 aa  229  7e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  32.33 
 
 		 505 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  31.25 
 
 		 503 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  31.93 
 
 		 514 aa  216  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  32.84 
 
 		 485 aa  205  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  38.05 
 
 		 440 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  32.02 
 
 		 210 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  23.06 
 
 		 634 aa  103  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  26.37 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  23.98 
 
 		 426 aa  47.4  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>