23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0819 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  100 
 
 
505 aa  1026    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  89.26 
 
 
485 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  91.7 
 
 
505 aa  894    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  91.7 
 
 
505 aa  894    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  90.69 
 
 
506 aa  904    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  91.7 
 
 
505 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  43.88 
 
 
503 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  47.24 
 
 
514 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  41.88 
 
 
481 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  41.88 
 
 
481 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  42.12 
 
 
482 aa  375  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  35.86 
 
 
643 aa  271  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  33.64 
 
 
510 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  35.9 
 
 
545 aa  223  8e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  32.33 
 
 
493 aa  223  8e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  32.95 
 
 
498 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  32.64 
 
 
498 aa  220  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  32.27 
 
 
528 aa  207  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  40.38 
 
 
210 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  32.38 
 
 
440 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  25.4 
 
 
634 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  26.63 
 
 
426 aa  58.2  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  23.72 
 
 
211 aa  45.8  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>