20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0853 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  438  9.999999999999999e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  26.37 
 
 
493 aa  68.2  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  26.24 
 
 
545 aa  66.2  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  26.14 
 
 
481 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  26.14 
 
 
481 aa  63.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  26.45 
 
 
482 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  24.73 
 
 
510 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  25.62 
 
 
210 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  23.15 
 
 
528 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  23.03 
 
 
643 aa  57  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  22.35 
 
 
498 aa  53.1  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  22.35 
 
 
498 aa  52.4  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  24.36 
 
 
505 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  24.36 
 
 
505 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  24.36 
 
 
505 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  23.31 
 
 
503 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  24.26 
 
 
506 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  25.9 
 
 
514 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  23.72 
 
 
505 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  35.62 
 
 
405 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>