22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4788 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  100 
 
 		 510 aa  1043    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  51 
 
 		 528 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  53.67 
 
 		 498 aa  471  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  53.21 
 
 		 493 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  52.16 
 
 		 498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  43.41 
 
 		 545 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  37.41 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  37.41 
 
 		 481 aa  264  3e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  33.95 
 
 		 643 aa  247  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  36.05 
 
 		 482 aa  242  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  34.03 
 
 		 514 aa  231  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  34.1 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  34.1 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  34.1 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  33.56 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  33.86 
 
 		 506 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  31.25 
 
 		 503 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  32.72 
 
 		 485 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  33.81 
 
 		 440 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  25.42 
 
 		 634 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  30.77 
 
 		 210 aa  107  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  24.73 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>