23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3751 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  100 
 
 
643 aa  1329    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  36.89 
 
 
503 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  37.04 
 
 
514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  37.59 
 
 
481 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  37.59 
 
 
481 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  36.07 
 
 
482 aa  274  5.000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  36.32 
 
 
506 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  36.26 
 
 
505 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  36.26 
 
 
505 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  36.26 
 
 
505 aa  269  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  35.88 
 
 
505 aa  269  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0108  hypothetical protein  36.61 
 
 
440 aa  265  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.713971  normal  0.22774 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  34.98 
 
 
493 aa  257  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  33.95 
 
 
510 aa  246  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  34.22 
 
 
485 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  35.09 
 
 
545 aa  231  2e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
498 aa  227  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  34.19 
 
 
498 aa  226  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  34.49 
 
 
528 aa  225  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  23.34 
 
 
634 aa  173  6.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  40.39 
 
 
210 aa  161  3e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0854  hypothetical protein  26.81 
 
 
426 aa  103  9e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00337014  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  23.03 
 
 
211 aa  57  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>