21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0107 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0107  hypothetical protein  100 
 
 
210 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.216808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3751  hypothetical protein  40.39 
 
 
643 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0819  hypothetical protein  40.38 
 
 
505 aa  159  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.307311  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4270  hypothetical protein  39.91 
 
 
506 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132934  normal  0.0630852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3476  hypothetical protein  39.34 
 
 
505 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286705  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4890  hypothetical protein  39.34 
 
 
505 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.368247  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5396  hypothetical protein  39.34 
 
 
505 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4235  hypothetical protein  42.93 
 
 
481 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4123  putative transmembrane protein  42.93 
 
 
481 aa  156  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0709153 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3458  hypothetical protein  38.21 
 
 
514 aa  151  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05340  hypothetical protein  39.71 
 
 
482 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4739  putative transmembrane protein  34.62 
 
 
528 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4098  putative transmembrane protein  35.61 
 
 
498 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.472468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3448  putative transmembrane protein  35.61 
 
 
498 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.707869  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3301  transmembrane protein  36.23 
 
 
503 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00618037  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4797  hypothetical protein  39.58 
 
 
485 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.248182  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0247  hypothetical protein  33.8 
 
 
545 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.267377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5268  putative transmembrane protein  32.02 
 
 
493 aa  115  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.54014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4788  putative transmembrane protein  30.77 
 
 
510 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.570342  normal  0.774266 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0853  hypothetical protein  25.62 
 
 
211 aa  57.4  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00120115  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1572  hypothetical protein  25.37 
 
 
634 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>