37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0724 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  205  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2567  transmembrane protein  73.83 
 
 		 129 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  54.21 
 
 		 107 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  54.21 
 
 		 107 aa  89.4  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  57.8 
 
 		 128 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  48.91 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  46.74 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  41.03 
 
 		 108 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  46.74 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  46.74 
 
 		 173 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  46.74 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  40.85 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  35.11 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  42.65 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  39.47 
 
 		 110 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  39.73 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0984  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1008  hypothetical protein  48.91 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.37363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1049  hypothetical protein  48.91 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0570  hypothetical protein  48.91 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4162  hypothetical protein  48.91 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  38.81 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2255  hypothetical protein  47.83 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0929  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.506094  normal  0.930521 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  42.11 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0925  hypothetical protein  46.74 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0757286  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  36.62 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  39.47 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  32.84 
 
 		 95 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  39.71 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  34.44 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>