25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2246 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  232  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  50.47 
 
 
106 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  49.54 
 
 
108 aa  103  9e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  58.9 
 
 
97 aa  95.5  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  60.27 
 
 
110 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  64.71 
 
 
112 aa  94.4  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  52.33 
 
 
93 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  61.19 
 
 
114 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  56.16 
 
 
106 aa  90.1  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  49.45 
 
 
95 aa  87.8  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  38.61 
 
 
121 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  39.73 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  39.71 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  34.29 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  30.39 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  30.39 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  30.39 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  30.39 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  30.1 
 
 
173 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  30.1 
 
 
149 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  30.39 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  33.33 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0537406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>