28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0966 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  212  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  62.32 
 
 		 112 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  55.56 
 
 		 93 aa  87  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  50.53 
 
 		 101 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  50.47 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  52.56 
 
 		 106 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  55.56 
 
 		 97 aa  83.2  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  42.27 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  48.15 
 
 		 108 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  52.78 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  55.22 
 
 		 114 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  42.16 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  43.75 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  40 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  34 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  36.17 
 
 		 164 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  33 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1869  hypothetical protein  34.94 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  36.17 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  36.17 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1069  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0663942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0925  hypothetical protein  35 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0141661  normal  0.392211 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  36.17 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  36.17 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  37.63 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>