45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3033 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  241  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  42.16 
 
 
106 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  43.9 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  33.7 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  44.3 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  39.73 
 
 
97 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  39.71 
 
 
112 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  34.09 
 
 
93 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  39.13 
 
 
95 aa  63.5  0.0000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0933  hypothetical protein  43.37 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  35.53 
 
 
108 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  35.53 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  37.68 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  38.61 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  37.78 
 
 
149 aa  57  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  37.78 
 
 
164 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  43.86 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  39.08 
 
 
171 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  38.24 
 
 
128 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  37.14 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  39.08 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  37.14 
 
 
107 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  37.08 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  42.11 
 
 
107 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  34 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  39.33 
 
 
97 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  38.37 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0925  hypothetical protein  37.31 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0141661  normal  0.392211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1069  hypothetical protein  37.31 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0663942  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2567  transmembrane protein  36.36 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2295  hypothetical protein  35.42 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0984  hypothetical protein  34 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833895  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4162  hypothetical protein  40.2 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1008  hypothetical protein  40.2 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.37363  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0570  hypothetical protein  40.2 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1049  hypothetical protein  40.2 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2255  hypothetical protein  38.24 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0929  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.506094  normal  0.930521 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0925  hypothetical protein  36 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0757286  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1869  hypothetical protein  38.33 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1616  hypothetical protein  35.29 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1028  hypothetical protein  35.29 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.771567  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1435  hypothetical protein  27.27 
 
 
123 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.080987  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>