29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1612 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  219  7e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  82.19 
 
 		 97 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  78.08 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  78.08 
 
 		 108 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  78.95 
 
 		 106 aa  117  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  63.16 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  82.09 
 
 		 114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  76.06 
 
 		 93 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  64.29 
 
 		 95 aa  101  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  49.11 
 
 		 106 aa  98.2  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  63.01 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  39.39 
 
 		 107 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  32.32 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  42.47 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  35.11 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  35.11 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  36 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  35.11 
 
 		 173 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  35.11 
 
 		 164 aa  52  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  35.11 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  34.74 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  32.08 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  35.05 
 
 		 97 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  32.99 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2567  transmembrane protein  36.26 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>