27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0958 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  186  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  43.55 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  39.53 
 
 
124 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  32.53 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  33.75 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  50 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  28.57 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  35.62 
 
 
110 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  29.21 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  35.82 
 
 
112 aa  47.8  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  27.17 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  46.15 
 
 
173 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  46.15 
 
 
164 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  46.15 
 
 
171 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  45.45 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  33.82 
 
 
106 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  34.25 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  31.25 
 
 
106 aa  44.7  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  33.77 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  31.34 
 
 
114 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0925  hypothetical protein  43.4 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0141661  normal  0.392211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1069  hypothetical protein  43.4 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0663942  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  34.48 
 
 
114 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  45.45 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>