32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3287 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  100 
 
 
114 aa  225  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  72.81 
 
 
108 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  69.3 
 
 
110 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  84.62 
 
 
106 aa  133  9e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  86.3 
 
 
97 aa  130  9e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  65 
 
 
101 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  64.95 
 
 
93 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  82.09 
 
 
112 aa  113  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  61.29 
 
 
95 aa  108  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  48.08 
 
 
106 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  44.74 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  43.42 
 
 
124 aa  60.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  37.37 
 
 
107 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  32.99 
 
 
121 aa  52.8  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  36.17 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  36.17 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  36.17 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  36.17 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  36.99 
 
 
107 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  34.04 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  36.17 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  35.62 
 
 
107 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  33.33 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  28.89 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4162  hypothetical protein  38.3 
 
 
163 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1049  hypothetical protein  38.3 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0570  hypothetical protein  38.3 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1008  hypothetical protein  38.3 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.37363  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>