36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1049 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1049  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  288  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0570  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  288  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4162  hypothetical protein  91.03 
 
 
163 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1008  hypothetical protein  98.97 
 
 
97 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.37363  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2991  hypothetical protein  78.63 
 
 
171 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2880  hypothetical protein  78.63 
 
 
173 aa  157  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0544764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1640  hypothetical protein  86.41 
 
 
149 aa  157  4e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.933177  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0425  hypothetical protein  78.63 
 
 
164 aa  157  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23971  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2569  hypothetical protein  87.63 
 
 
97 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2943  hypothetical protein  87.63 
 
 
97 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0944  hypothetical protein  87.63 
 
 
97 aa  147  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0748  hypothetical protein  84.54 
 
 
97 aa  140  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.119294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2999  hypothetical protein  82.47 
 
 
97 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.802353  hitchhiker  0.00489735 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2255  hypothetical protein  93.81 
 
 
97 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0925  hypothetical protein  92.78 
 
 
97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0757286  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0929  hypothetical protein  92.78 
 
 
97 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.506094  normal  0.930521 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0984  hypothetical protein  75.26 
 
 
97 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.833895  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1282  hypothetical protein  44.68 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.179394  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0852  hypothetical protein  48.35 
 
 
107 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.951265  normal  0.655516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0724  hypothetical protein  48.91 
 
 
107 aa  65.5  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0104559  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0781  putative transmembrane protein  47.47 
 
 
107 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0537406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0911  hypothetical protein  46.24 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4726  hypothetical protein  38.64 
 
 
106 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.723603  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1787  hypothetical protein  42.65 
 
 
93 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00304521 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3912  hypothetical protein  42.65 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0250234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3033  hypothetical protein  40.2 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.1087  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2067  hypothetical protein  41.25 
 
 
124 aa  57.4  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000373882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1612  hypothetical protein  42.65 
 
 
112 aa  57.4  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2798  hypothetical protein  40.91 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129709 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1389  hypothetical protein  38.46 
 
 
108 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0150036  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2471  hypothetical protein  41.18 
 
 
110 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42235  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0966  hypothetical protein  38.3 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3287  hypothetical protein  39.39 
 
 
114 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00585149  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0958  hypothetical protein  44.12 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0216417  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1564  hypothetical protein  37.5 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2246  hypothetical protein  32.35 
 
 
114 aa  47  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>