23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1844 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1844  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 340 aa  689    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0085  WD40 domain protein beta Propeller  95.88 
 
 		 352 aa  662    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  36.28 
 
 		 567 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  21.14 
 
 		 292 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  24.29 
 
 		 667 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  27.4 
 
 		 435 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  34.48 
 
 		 701 aa  50.1  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  30.58 
 
 		 450 aa  49.7  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  35.71 
 
 		 590 aa  45.8  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  25.47 
 
 		 1028 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  26.95 
 
 		 435 aa  45.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  31.58 
 
 		 398 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  33.33 
 
 		 572 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  30.63 
 
 		 427 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  24.69 
 
 		 438 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  24.88 
 
 		 415 aa  44.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  25.5 
 
 		 432 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.89 
 
 		 443 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  24.56 
 
 		 414 aa  43.5  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0214  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  31.4 
 
 		 331 aa  43.5  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  24.18 
 
 		 969 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  35.14 
 
 		 970 aa  43.1  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  24.31 
 
 		 419 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>