More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6152 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  79.58 
 
 
1121 aa  719    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  69.63 
 
 
439 aa  642    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  76.7 
 
 
441 aa  710    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  74.6 
 
 
448 aa  684    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  100 
 
 
444 aa  904    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  76.43 
 
 
445 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  74.15 
 
 
445 aa  692    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  75.11 
 
 
441 aa  687    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  83.37 
 
 
443 aa  756    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  72.08 
 
 
461 aa  624  1e-177  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  67.58 
 
 
448 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  67.81 
 
 
448 aa  615  1e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  68.28 
 
 
448 aa  617  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  67.43 
 
 
444 aa  615  1e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  67.51 
 
 
457 aa  615  1e-175  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  66.74 
 
 
444 aa  611  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  53.72 
 
 
457 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.06 
 
 
458 aa  477  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.88 
 
 
441 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  51.82 
 
 
458 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.99 
 
 
439 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.82 
 
 
457 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  53.06 
 
 
441 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  53.59 
 
 
453 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.06 
 
 
457 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  53.81 
 
 
442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.79 
 
 
445 aa  448  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  52.51 
 
 
454 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  54.34 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.25 
 
 
446 aa  442  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.17 
 
 
452 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  51.38 
 
 
452 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  52.42 
 
 
450 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.61 
 
 
456 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  52.06 
 
 
454 aa  428  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.69 
 
 
452 aa  422  1e-117  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  50.68 
 
 
434 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  47.83 
 
 
448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.87 
 
 
460 aa  407  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.08 
 
 
441 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.53 
 
 
457 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  48.3 
 
 
450 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  49.88 
 
 
451 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.32 
 
 
449 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  48.52 
 
 
450 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  48.64 
 
 
455 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  49.66 
 
 
447 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  48.18 
 
 
450 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.25 
 
 
440 aa  387  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  47.07 
 
 
448 aa  385  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  46.61 
 
 
449 aa  379  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  46.42 
 
 
429 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  47.95 
 
 
449 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  46.19 
 
 
440 aa  376  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.22 
 
 
450 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.27 
 
 
448 aa  374  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  47.74 
 
 
458 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.74 
 
 
447 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  45.08 
 
 
449 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.8 
 
 
474 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.39 
 
 
439 aa  365  1e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  45.91 
 
 
442 aa  365  1e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.15 
 
 
442 aa  365  1e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.91 
 
 
447 aa  362  6e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  48.29 
 
 
451 aa  362  7.0000000000000005e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.32 
 
 
459 aa  361  1e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.43 
 
 
445 aa  360  2e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45 
 
 
451 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.05 
 
 
444 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  46.5 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.82 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  43.64 
 
 
451 aa  355  6.999999999999999e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  43.97 
 
 
454 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.93 
 
 
443 aa  355  1e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  44.7 
 
 
455 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  45.25 
 
 
472 aa  353  5e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  44.98 
 
 
492 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  44.77 
 
 
452 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  45.23 
 
 
451 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  44.55 
 
 
448 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  44.09 
 
 
453 aa  343  2.9999999999999997e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  43.96 
 
 
449 aa  341  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  46.67 
 
 
454 aa  341  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  42.6 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.44 
 
 
453 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.57 
 
 
448 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  42.86 
 
 
442 aa  334  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  42.86 
 
 
451 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.6 
 
 
440 aa  332  6e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  43.31 
 
 
450 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  42.99 
 
 
458 aa  328  8e-89  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  41.5 
 
 
442 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  41.61 
 
 
478 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  41.89 
 
 
451 aa  326  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.18 
 
 
449 aa  325  7e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  43.53 
 
 
467 aa  325  8.000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  43.31 
 
 
469 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3494  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.95 
 
 
460 aa  324  2e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.748879 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6020  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  41.18 
 
 
443 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  40.82 
 
 
436 aa  322  9.000000000000001e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>