More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4938 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  77.21 
 
 
449 aa  652    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  100 
 
 
451 aa  899    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  66.67 
 
 
442 aa  560  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  68.07 
 
 
454 aa  544  1e-153  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  61.26 
 
 
449 aa  530  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  58.97 
 
 
458 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  58.92 
 
 
447 aa  510  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  61.21 
 
 
459 aa  509  1e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  59.41 
 
 
455 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  58.35 
 
 
474 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  62.16 
 
 
451 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  59.13 
 
 
448 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.01 
 
 
447 aa  490  1e-137  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  57.4 
 
 
453 aa  491  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.49 
 
 
457 aa  485  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  61.52 
 
 
472 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  55.28 
 
 
457 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  53.15 
 
 
458 aa  475  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.25 
 
 
457 aa  471  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.42 
 
 
439 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  54.95 
 
 
458 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  55.86 
 
 
453 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  52.81 
 
 
454 aa  466  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.95 
 
 
441 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.52 
 
 
457 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  54.16 
 
 
455 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.21 
 
 
441 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.6 
 
 
452 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.02 
 
 
456 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.9 
 
 
445 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.55 
 
 
442 aa  450  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  52.82 
 
 
450 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  52.95 
 
 
452 aa  444  1e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  53.41 
 
 
451 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  53.26 
 
 
434 aa  436  1e-121  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  51.95 
 
 
436 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  52.27 
 
 
447 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.77 
 
 
460 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.8 
 
 
449 aa  429  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  50.68 
 
 
448 aa  425  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  50.8 
 
 
445 aa  427  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.32 
 
 
441 aa  428  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  52.13 
 
 
467 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.19 
 
 
429 aa  418  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  50.11 
 
 
492 aa  419  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.44 
 
 
452 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  49.66 
 
 
449 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  50.23 
 
 
429 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  51.93 
 
 
450 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.2 
 
 
441 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.64 
 
 
446 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  50.9 
 
 
457 aa  409  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  48.52 
 
 
451 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.3 
 
 
440 aa  408  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  49.77 
 
 
450 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.67 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  50.34 
 
 
454 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.67 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.67 
 
 
468 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  50.11 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.77 
 
 
450 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  50.45 
 
 
450 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  50.11 
 
 
444 aa  402  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  50.11 
 
 
454 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  50.8 
 
 
469 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  50.34 
 
 
444 aa  404  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  50.68 
 
 
448 aa  403  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  48.88 
 
 
448 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  47.84 
 
 
439 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.29 
 
 
445 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  49.89 
 
 
461 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  48.06 
 
 
445 aa  395  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.5 
 
 
445 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.37 
 
 
448 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  48.64 
 
 
444 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.73 
 
 
448 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.6 
 
 
441 aa  385  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.69 
 
 
445 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  48.36 
 
 
455 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.76 
 
 
455 aa  380  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.05 
 
 
448 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  47.18 
 
 
443 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  48.84 
 
 
445 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  44.32 
 
 
440 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.87 
 
 
451 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.37 
 
 
448 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  45.33 
 
 
1121 aa  364  1e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  45.87 
 
 
441 aa  365  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  44.92 
 
 
448 aa  363  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  43.79 
 
 
453 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  49.65 
 
 
447 aa  362  8e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  46.19 
 
 
431 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.19 
 
 
431 aa  358  9e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.95 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.62 
 
 
444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  43.97 
 
 
451 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  45.96 
 
 
431 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  45.96 
 
 
431 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  45.96 
 
 
431 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  45.96 
 
 
431 aa  356  5e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>