More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4825 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  95.46 
 
 
441 aa  857    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  100 
 
 
441 aa  894    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  85.13 
 
 
439 aa  771    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  80.05 
 
 
442 aa  719    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  64.84 
 
 
457 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  63.72 
 
 
458 aa  587  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  65.07 
 
 
458 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  63.43 
 
 
457 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  65.14 
 
 
434 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  64.17 
 
 
454 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  63.15 
 
 
445 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  62.7 
 
 
445 aa  570  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  63.18 
 
 
453 aa  561  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  60.9 
 
 
452 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  60.67 
 
 
452 aa  541  1e-153  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  61.26 
 
 
457 aa  538  9.999999999999999e-153  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  60.18 
 
 
452 aa  535  1e-151  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  61.28 
 
 
460 aa  526  1e-148  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  57.69 
 
 
456 aa  523  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  56.69 
 
 
454 aa  517  1.0000000000000001e-145  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  58.99 
 
 
448 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  60.6 
 
 
450 aa  517  1.0000000000000001e-145  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  59.35 
 
 
451 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  58.43 
 
 
447 aa  501  1e-141  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  57.88 
 
 
449 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.73 
 
 
457 aa  497  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  55.96 
 
 
455 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  55.23 
 
 
446 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  58.12 
 
 
448 aa  490  1e-137  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  57.34 
 
 
444 aa  486  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.97 
 
 
448 aa  482  1e-135  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  56.66 
 
 
457 aa  483  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.42 
 
 
445 aa  478  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  55.48 
 
 
450 aa  479  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  56.88 
 
 
444 aa  480  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  53.97 
 
 
448 aa  476  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  52.39 
 
 
440 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.32 
 
 
441 aa  477  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  55.07 
 
 
449 aa  473  1e-132  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  55.02 
 
 
450 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  54.88 
 
 
444 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.64 
 
 
440 aa  474  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  56.19 
 
 
442 aa  472  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.42 
 
 
441 aa  468  1.0000000000000001e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.36 
 
 
441 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  53.74 
 
 
443 aa  466  9.999999999999999e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  52.97 
 
 
445 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  54.79 
 
 
450 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  54.36 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.92 
 
 
450 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  54.79 
 
 
474 aa  456  1e-127  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  53.18 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  54.3 
 
 
447 aa  453  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.13 
 
 
447 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.16 
 
 
448 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  53.13 
 
 
1121 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  52.95 
 
 
448 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  53.93 
 
 
449 aa  444  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.05 
 
 
448 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  52.81 
 
 
449 aa  444  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  52.93 
 
 
458 aa  444  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  51.25 
 
 
441 aa  431  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  52.39 
 
 
461 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  52.28 
 
 
439 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  49.89 
 
 
448 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  51.02 
 
 
443 aa  424  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50 
 
 
453 aa  419  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.55 
 
 
445 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  49.54 
 
 
444 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  49.67 
 
 
452 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.51 
 
 
448 aa  413  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  53.95 
 
 
451 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  51.35 
 
 
451 aa  414  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  49.89 
 
 
451 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  52.16 
 
 
472 aa  412  1e-114  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  49.09 
 
 
453 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.41 
 
 
451 aa  411  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  48.97 
 
 
436 aa  408  1.0000000000000001e-112  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.39 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  52.52 
 
 
454 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  48.97 
 
 
442 aa  402  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  49.89 
 
 
455 aa  405  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  46.62 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.11 
 
 
459 aa  398  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  46.71 
 
 
451 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  47.26 
 
 
451 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  45.91 
 
 
442 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  47.25 
 
 
492 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  46.36 
 
 
442 aa  388  1e-106  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  47.82 
 
 
445 aa  384  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.14 
 
 
440 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  45.93 
 
 
438 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  45.77 
 
 
458 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.14 
 
 
429 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  44.9 
 
 
435 aa  362  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.44 
 
 
449 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  45.66 
 
 
454 aa  360  4e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  47.31 
 
 
467 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.84 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  46.62 
 
 
455 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>