More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2149 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  83.18 
 
 		 458 aa  776    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  97.29 
 
 		 442 aa  893    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  85.91 
 
 		 451 aa  794    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  75.29 
 
 		 441 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  909    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  78.26 
 
 		 438 aa  716    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  58.26 
 
 		 441 aa  538  9.999999999999999e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  58.99 
 
 		 444 aa  535  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  59.68 
 
 		 447 aa  534  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  59.4 
 
 		 443 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  59.86 
 
 		 452 aa  533  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  57.31 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  57.67 
 
 		 448 aa  530  1e-149  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  57.31 
 
 		 450 aa  528  1e-149  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  57.7 
 
 		 450 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.31 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  59.22 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  56.98 
 
 		 448 aa  524  1e-147  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.31 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.31 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  60.29 
 
 		 441 aa  523  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  58.31 
 
 		 440 aa  524  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.31 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  58.31 
 
 		 440 aa  523  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4189  flavin-dependent oxidoreductase  59.17 
 
 		 450 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  57.85 
 
 		 439 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5198  monooxygenase  59.42 
 
 		 430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  57.48 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  54.32 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5561  putative nitrilotriacetate monooxygenase protein component A  55.45 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.200364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  55.05 
 
 		 445 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.6 
 
 		 449 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  54.4 
 
 		 442 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  51.58 
 
 		 449 aa  475  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  51.35 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  52.3 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  49.66 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  50 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  48.87 
 
 		 454 aa  402  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.44 
 
 		 457 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  48.44 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.98 
 
 		 457 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  48.18 
 
 		 439 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.91 
 
 		 478 aa  397  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  46.67 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.62 
 
 		 460 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  46.82 
 
 		 441 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.36 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  45.66 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.56 
 
 		 439 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  46.01 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  47.11 
 
 		 435 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  46.94 
 
 		 445 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.31 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  44.37 
 
 		 453 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  45.33 
 
 		 449 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  47.03 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.71 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  45.39 
 
 		 429 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  43.92 
 
 		 458 aa  374  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.45 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.95 
 
 		 452 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.01 
 
 		 452 aa  371  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  46.24 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.95 
 
 		 446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.04 
 
 		 452 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.49 
 
 		 445 aa  361  1e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.34 
 
 		 448 aa  359  6e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  45.56 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.7 
 
 		 440 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  44.09 
 
 		 454 aa  354  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  42.92 
 
 		 448 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  43.58 
 
 		 440 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  45.7 
 
 		 474 aa  352  5e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.79 
 
 		 441 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  44.82 
 
 		 450 aa  352  7e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  45.31 
 
 		 442 aa  352  1e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.05 
 
 		 445 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.41 
 
 		 439 aa  347  2e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  44.77 
 
 		 434 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  43.47 
 
 		 450 aa  346  4e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  42.69 
 
 		 445 aa  346  6e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  41.78 
 
 		 448 aa  344  1e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  43.25 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.38 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  43.28 
 
 		 444 aa  344  2e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  43.28 
 
 		 444 aa  343  4e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  42.47 
 
 		 451 aa  343  4e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  43.84 
 
 		 449 aa  342  9e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  42.6 
 
 		 457 aa  341  2e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.08 
 
 		 441 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  41.4 
 
 		 443 aa  338  9e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  42.92 
 
 		 447 aa  334  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  42.86 
 
 		 444 aa  334  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>