More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3862 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4189  flavin-dependent oxidoreductase  89.6 
 
 		 450 aa  798    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  97.96 
 
 		 441 aa  878    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  84.37 
 
 		 440 aa  757    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  84.6 
 
 		 440 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  94.03 
 
 		 450 aa  863    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  78.57 
 
 		 444 aa  718    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  84.37 
 
 		 440 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  93.42 
 
 		 439 aa  841    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  84.37 
 
 		 440 aa  757    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  94.52 
 
 		 450 aa  852    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 		 452 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  76.09 
 
 		 447 aa  690    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  93.58 
 
 		 450 aa  863    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  84.6 
 
 		 440 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  84.6 
 
 		 440 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  84.37 
 
 		 440 aa  757    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  67.05 
 
 		 449 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5561  putative nitrilotriacetate monooxygenase protein component A  67.74 
 
 		 449 aa  625  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.200364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5198  monooxygenase  69.23 
 
 		 430 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  65.68 
 
 		 449 aa  587  1e-166  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  65 
 
 		 449 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  65.45 
 
 		 449 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  61.48 
 
 		 438 aa  536  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  59.86 
 
 		 442 aa  533  1e-150  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  60.73 
 
 		 458 aa  531  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  59.16 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  58.43 
 
 		 451 aa  522  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  59.58 
 
 		 441 aa  503  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  53.23 
 
 		 448 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  53.92 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  53.92 
 
 		 451 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  52.99 
 
 		 448 aa  464  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  52.97 
 
 		 441 aa  462  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  54.99 
 
 		 443 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  51.61 
 
 		 442 aa  440  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  49.66 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  50.57 
 
 		 445 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.64 
 
 		 449 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  46.76 
 
 		 429 aa  380  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  44.72 
 
 		 454 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46 
 
 		 478 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  47.94 
 
 		 439 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.17 
 
 		 457 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  45.84 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.14 
 
 		 460 aa  362  9e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.69 
 
 		 457 aa  360  3e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  43.5 
 
 		 458 aa  359  6e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  47.49 
 
 		 435 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.06 
 
 		 452 aa  356  3.9999999999999996e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.41 
 
 		 445 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  42.53 
 
 		 458 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.76 
 
 		 452 aa  352  8e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.57 
 
 		 457 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.05 
 
 		 454 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.58 
 
 		 456 aa  350  3e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.19 
 
 		 441 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.86 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.19 
 
 		 442 aa  343  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.19 
 
 		 450 aa  343  5e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.92 
 
 		 441 aa  343  5e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  40.94 
 
 		 453 aa  342  9e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  43.95 
 
 		 450 aa  339  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.77 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  42.82 
 
 		 440 aa  335  7e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  43.49 
 
 		 451 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  43.25 
 
 		 441 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.55 
 
 		 440 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  42.08 
 
 		 455 aa  330  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  44.16 
 
 		 492 aa  328  9e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.27 
 
 		 457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  42.43 
 
 		 449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.76 
 
 		 440 aa  327  3e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  42.63 
 
 		 434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  42.98 
 
 		 474 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  42.83 
 
 		 458 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.82 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  42.47 
 
 		 447 aa  319  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.09 
 
 		 446 aa  319  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.39 
 
 		 448 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.51 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  42.11 
 
 		 448 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  41.69 
 
 		 448 aa  316  6e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  42.12 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  42.92 
 
 		 457 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  42.86 
 
 		 448 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.73 
 
 		 450 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  42.18 
 
 		 444 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  42.89 
 
 		 472 aa  311  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  42.18 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.5 
 
 		 441 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  40.73 
 
 		 448 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.06 
 
 		 449 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  41.16 
 
 		 443 aa  308  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  41.78 
 
 		 444 aa  307  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  41.43 
 
 		 447 aa  306  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>