More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4322 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4189  flavin-dependent oxidoreductase  90.25 
 
 
450 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  94.85 
 
 
450 aa  832    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  85.68 
 
 
440 aa  749    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  85.92 
 
 
440 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  76.24 
 
 
447 aa  677    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  100 
 
 
441 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  85.92 
 
 
440 aa  750    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  94.1 
 
 
450 aa  843    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  79.76 
 
 
444 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  93.88 
 
 
439 aa  843    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  85.68 
 
 
440 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  97.96 
 
 
452 aa  878    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  93.88 
 
 
450 aa  843    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  85.92 
 
 
440 aa  750    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  85.68 
 
 
440 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  85.68 
 
 
440 aa  749    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  66.9 
 
 
449 aa  615  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5198  monooxygenase  70.55 
 
 
430 aa  616  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5561  putative nitrilotriacetate monooxygenase protein component A  68.08 
 
 
449 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.200364  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  64.73 
 
 
449 aa  566  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  64.5 
 
 
449 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  64.04 
 
 
449 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  62.23 
 
 
438 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  61.12 
 
 
458 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  60.29 
 
 
442 aa  523  1e-147  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  59.81 
 
 
442 aa  518  1e-146  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  59.26 
 
 
451 aa  513  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  59.2 
 
 
441 aa  493  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  54.93 
 
 
448 aa  461  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  53.63 
 
 
441 aa  456  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  54.57 
 
 
451 aa  455  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  54.12 
 
 
444 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  53.32 
 
 
448 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  55.16 
 
 
443 aa  455  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  51.76 
 
 
442 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  49.88 
 
 
438 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  50.47 
 
 
445 aa  410  1e-113  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.46 
 
 
449 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  46.82 
 
 
478 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  44.83 
 
 
454 aa  360  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  49.05 
 
 
439 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  45.61 
 
 
429 aa  359  7e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  45.85 
 
 
445 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.7 
 
 
457 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.34 
 
 
460 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  43.58 
 
 
458 aa  348  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  48.1 
 
 
435 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.12 
 
 
457 aa  347  3e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.21 
 
 
445 aa  345  8e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.62 
 
 
456 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.93 
 
 
452 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.34 
 
 
454 aa  340  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.34 
 
 
439 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  41.94 
 
 
458 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  43.33 
 
 
452 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.52 
 
 
441 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.47 
 
 
450 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  44.65 
 
 
442 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.26 
 
 
457 aa  334  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  42.03 
 
 
453 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.22 
 
 
441 aa  332  6e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  43.71 
 
 
440 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.24 
 
 
452 aa  331  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  43.56 
 
 
441 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  43.91 
 
 
451 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  43.05 
 
 
450 aa  325  1e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  44.6 
 
 
492 aa  323  5e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.86 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.56 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  43.06 
 
 
434 aa  317  3e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  42.19 
 
 
449 aa  317  4e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.78 
 
 
446 aa  316  6e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  43.24 
 
 
474 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  43.32 
 
 
447 aa  316  6e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  41.67 
 
 
455 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.97 
 
 
457 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  41.9 
 
 
448 aa  311  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  42.56 
 
 
458 aa  311  2e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.06 
 
 
439 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  44 
 
 
457 aa  308  9e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.78 
 
 
445 aa  308  1.0000000000000001e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  43.22 
 
 
444 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  42.12 
 
 
448 aa  306  6e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.19 
 
 
448 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  42.06 
 
 
442 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  42.82 
 
 
444 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  41.97 
 
 
472 aa  302  9e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  42.59 
 
 
469 aa  301  1e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.49 
 
 
450 aa  301  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  42.79 
 
 
448 aa  301  2e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  41.47 
 
 
448 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  40.6 
 
 
436 aa  300  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.72 
 
 
441 aa  300  4e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  41.84 
 
 
439 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  41.42 
 
 
450 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>