More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2425 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  100 
 
 		 448 aa  917    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  78.75 
 
 		 444 aa  711    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  94.64 
 
 		 448 aa  871    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  76.83 
 
 		 443 aa  694    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  77.29 
 
 		 441 aa  704    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  64.5 
 
 		 442 aa  588  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  64.27 
 
 		 451 aa  587  1e-166  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  59.78 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  57.67 
 
 		 442 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  57.53 
 
 		 458 aa  525  1e-148  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  57.6 
 
 		 438 aa  525  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  56.29 
 
 		 442 aa  523  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  57.24 
 
 		 451 aa  523  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  56.74 
 
 		 441 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  54.13 
 
 		 444 aa  472  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1697  flavin-dependent oxidoreductase  54.36 
 
 		 447 aa  471  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.368997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  53.23 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.46 
 
 		 440 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  53.55 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  54.46 
 
 		 440 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  54 
 
 		 450 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  53.01 
 
 		 450 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.23 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.23 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.23 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  54.21 
 
 		 449 aa  462  1e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.23 
 
 		 440 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  54.93 
 
 		 441 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5198  monooxygenase  53.4 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4189  flavin-dependent oxidoreductase  55.15 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  53.42 
 
 		 439 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  49.22 
 
 		 449 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5561  putative nitrilotriacetate monooxygenase protein component A  50 
 
 		 449 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.200364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.34 
 
 		 449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  51.58 
 
 		 478 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3053  putative monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3181  putative monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1023  putative monooxygenase  50 
 
 		 449 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0217673  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2289  putative monooxygenase  49.77 
 
 		 449 aa  438  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  48.97 
 
 		 438 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  49.89 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.6 
 
 		 439 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  48.65 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  48.97 
 
 		 441 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  48.87 
 
 		 458 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  49.43 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  48.21 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3218  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  52.05 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.23 
 
 		 457 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  46.95 
 
 		 458 aa  402  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.76 
 
 		 457 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  47.42 
 
 		 454 aa  401  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.06 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  48.51 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.09 
 
 		 452 aa  396  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  47.86 
 
 		 452 aa  398  1e-109  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  50 
 
 		 454 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.41 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2515  putative nitrilotriacetate monooxygenase, component A  50.8 
 
 		 435 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261163 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  46.31 
 
 		 429 aa  390  1e-107  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  46.88 
 
 		 450 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.12 
 
 		 446 aa  382  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  48.98 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.28 
 
 		 456 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.49 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  46.71 
 
 		 452 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.05 
 
 		 441 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  47.19 
 
 		 455 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  45.25 
 
 		 448 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  45.56 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  44.6 
 
 		 436 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  46.36 
 
 		 450 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.97 
 
 		 448 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  45.68 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  45.68 
 
 		 474 aa  367  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  45.21 
 
 		 450 aa  365  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  44.87 
 
 		 449 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  47.49 
 
 		 442 aa  363  2e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  45.62 
 
 		 445 aa  364  2e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.34 
 
 		 440 aa  364  2e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  45.77 
 
 		 450 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.45 
 
 		 439 aa  363  4e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  43.02 
 
 		 440 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  44.75 
 
 		 451 aa  361  2e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  45.7 
 
 		 457 aa  358  9e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  45.89 
 
 		 444 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.82 
 
 		 459 aa  357  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  44.44 
 
 		 443 aa  357  2.9999999999999997e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  45.31 
 
 		 472 aa  355  1e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  45.43 
 
 		 444 aa  352  8e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  43.41 
 
 		 448 aa  351  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  43.89 
 
 		 451 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.88 
 
 		 449 aa  350  4e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  43.43 
 
 		 458 aa  349  4e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  43.28 
 
 		 448 aa  349  7e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  43.55 
 
 		 492 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>