More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0906 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  70.6 
 
 
1121 aa  641    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  68.04 
 
 
448 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  72.31 
 
 
439 aa  671    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  76.59 
 
 
448 aa  716    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  68.03 
 
 
457 aa  635    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  75.11 
 
 
444 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  74.31 
 
 
445 aa  688    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  70.45 
 
 
448 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  73 
 
 
445 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  100 
 
 
441 aa  901    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  74.77 
 
 
443 aa  697    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  75.06 
 
 
441 aa  698    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  68.33 
 
 
444 aa  635    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  71.14 
 
 
448 aa  659    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  67.8 
 
 
444 aa  631  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  68.41 
 
 
461 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  56.21 
 
 
457 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  55.94 
 
 
457 aa  499  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  56.36 
 
 
458 aa  495  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  54.52 
 
 
458 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.32 
 
 
441 aa  477  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  54.09 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  53.38 
 
 
457 aa  463  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  55.38 
 
 
445 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  55.61 
 
 
445 aa  462  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  53.27 
 
 
453 aa  463  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.09 
 
 
442 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  52.05 
 
 
441 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  52.71 
 
 
454 aa  452  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  54.92 
 
 
452 aa  451  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  53.9 
 
 
454 aa  445  1.0000000000000001e-124  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  53.39 
 
 
434 aa  443  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  54.19 
 
 
450 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  53.97 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  51.95 
 
 
452 aa  441  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.16 
 
 
446 aa  437  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.15 
 
 
456 aa  435  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.36 
 
 
460 aa  434  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.17 
 
 
449 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  52.9 
 
 
451 aa  421  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  49.55 
 
 
450 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  51.37 
 
 
447 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  49.08 
 
 
448 aa  408  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.32 
 
 
450 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  49.54 
 
 
429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.84 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.66 
 
 
457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  47.97 
 
 
448 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  49.44 
 
 
455 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.38 
 
 
441 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  48.17 
 
 
450 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  47.14 
 
 
449 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  48.65 
 
 
458 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  46.65 
 
 
440 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  47.52 
 
 
449 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.18 
 
 
448 aa  384  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  46.79 
 
 
450 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.18 
 
 
447 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.56 
 
 
445 aa  371  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.05 
 
 
451 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.17 
 
 
447 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  46.22 
 
 
442 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.82 
 
 
439 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  45.8 
 
 
449 aa  367  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.58 
 
 
474 aa  368  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  45.6 
 
 
451 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.12 
 
 
459 aa  365  1e-100  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  45.79 
 
 
442 aa  361  1e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  45.37 
 
 
451 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  45.52 
 
 
451 aa  361  2e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  45.35 
 
 
455 aa  360  2e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  44.34 
 
 
438 aa  359  5e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  45.21 
 
 
452 aa  358  9e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  44.92 
 
 
449 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.99 
 
 
445 aa  353  2.9999999999999997e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  44.67 
 
 
454 aa  351  1e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  43.92 
 
 
441 aa  349  7e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  45.09 
 
 
453 aa  348  1e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  44.5 
 
 
443 aa  345  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  44.55 
 
 
472 aa  345  8e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  44.29 
 
 
492 aa  345  8.999999999999999e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.95 
 
 
453 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  43.54 
 
 
448 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  44.06 
 
 
444 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2211  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.99 
 
 
448 aa  340  4e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284835  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  46.44 
 
 
454 aa  339  5e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2149  hypothetical protein  42.08 
 
 
442 aa  339  5e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  43.02 
 
 
440 aa  338  9.999999999999999e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0526  hypothetical protein  42.63 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2489  hypothetical protein  41.18 
 
 
442 aa  336  5e-91  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  43.51 
 
 
451 aa  335  5.999999999999999e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  42.31 
 
 
436 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0408  hypothetical protein  43.08 
 
 
458 aa  333  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1224  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.12 
 
 
449 aa  331  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6020  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  41.5 
 
 
443 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  43.51 
 
 
469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  43.91 
 
 
455 aa  326  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2295  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.67 
 
 
449 aa  325  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  43.67 
 
 
450 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  42.24 
 
 
441 aa  323  3e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>