More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0268 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  100 
 
 
448 aa  909    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  68.42 
 
 
441 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  91.03 
 
 
448 aa  828    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  70.45 
 
 
441 aa  650    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  66.82 
 
 
448 aa  633  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  66.67 
 
 
443 aa  625  1e-178  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  67.66 
 
 
439 aa  618  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  67.81 
 
 
444 aa  615  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  66.21 
 
 
445 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  64.91 
 
 
445 aa  598  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  65.99 
 
 
461 aa  589  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  63.47 
 
 
448 aa  587  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  64.25 
 
 
1121 aa  579  1e-164  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  62.5 
 
 
457 aa  580  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  63.04 
 
 
444 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  62.36 
 
 
444 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  54 
 
 
457 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  52.46 
 
 
458 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  51.48 
 
 
458 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  51.24 
 
 
457 aa  455  1e-127  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.28 
 
 
439 aa  449  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  51.48 
 
 
453 aa  448  1e-125  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  52.05 
 
 
441 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  51.59 
 
 
442 aa  440  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  50.68 
 
 
441 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  50.45 
 
 
457 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.95 
 
 
445 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  50 
 
 
454 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  50.34 
 
 
452 aa  431  1e-119  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  51.26 
 
 
445 aa  426  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  50.57 
 
 
454 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  51.47 
 
 
452 aa  421  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.44 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.75 
 
 
456 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  49.77 
 
 
450 aa  415  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  48.99 
 
 
451 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  50.46 
 
 
450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  47.74 
 
 
446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  50.11 
 
 
450 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  47.97 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  47.66 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  49.89 
 
 
449 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  47.02 
 
 
429 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.61 
 
 
460 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  49.54 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  48.05 
 
 
447 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  48.2 
 
 
450 aa  395  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.86 
 
 
457 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  49.55 
 
 
458 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  46.15 
 
 
449 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  46.15 
 
 
440 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  48.41 
 
 
455 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.29 
 
 
441 aa  380  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  46.35 
 
 
445 aa  377  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.04 
 
 
448 aa  376  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.84 
 
 
440 aa  376  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  46.45 
 
 
442 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  44.87 
 
 
448 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.01 
 
 
474 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  46.14 
 
 
449 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  46.52 
 
 
447 aa  365  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.07 
 
 
447 aa  368  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.91 
 
 
459 aa  363  2e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  43.57 
 
 
449 aa  362  5.0000000000000005e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  46.73 
 
 
451 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  43.36 
 
 
453 aa  355  7.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  44.22 
 
 
455 aa  355  1e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  44.06 
 
 
492 aa  348  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  44.55 
 
 
451 aa  347  2e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  43.74 
 
 
452 aa  347  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  43.53 
 
 
451 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  43.24 
 
 
451 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.34 
 
 
453 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.54 
 
 
439 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  45.25 
 
 
472 aa  342  9e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21660  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  43.89 
 
 
441 aa  342  1e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.714961  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  42.33 
 
 
449 aa  341  2e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  43.01 
 
 
454 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1172  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.43 
 
 
451 aa  338  9.999999999999999e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259723  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5093  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.83 
 
 
445 aa  338  1.9999999999999998e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  43.94 
 
 
442 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  44.7 
 
 
454 aa  331  1e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.52 
 
 
495 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.52 
 
 
468 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.52 
 
 
468 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.01 
 
 
440 aa  330  4e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21890  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  43.12 
 
 
443 aa  330  4e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  42.44 
 
 
469 aa  330  4e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.56 
 
 
444 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6020  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  41.82 
 
 
443 aa  329  7e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.74 
 
 
431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  43.64 
 
 
431 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.64 
 
 
431 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  43.74 
 
 
431 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  43.4 
 
 
450 aa  326  5e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  43.74 
 
 
431 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  43.74 
 
 
431 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  43.74 
 
 
431 aa  326  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  41.18 
 
 
436 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2090  hypothetical protein  40.95 
 
 
438 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.59319  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>