More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_01780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  100 
 
 
447 aa  889    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  62.35 
 
 
429 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0200  hypothetical protein  48.36 
 
 
434 aa  444  1e-123  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  47.03 
 
 
458 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.02 
 
 
448 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  47.09 
 
 
474 aa  379  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.57 
 
 
453 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  46.77 
 
 
449 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  48.39 
 
 
459 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.3 
 
 
447 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  48.36 
 
 
449 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  47.2 
 
 
492 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  44.75 
 
 
447 aa  366  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  46.65 
 
 
436 aa  364  1e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  49.65 
 
 
451 aa  360  2e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  43.58 
 
 
454 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  46.98 
 
 
451 aa  356  5e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  45.25 
 
 
457 aa  356  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  46.5 
 
 
442 aa  356  5.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.14 
 
 
458 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.3 
 
 
457 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  43.95 
 
 
455 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.47 
 
 
457 aa  351  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  44.8 
 
 
453 aa  351  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  45.41 
 
 
469 aa  349  7e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  45.06 
 
 
458 aa  348  8e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  47.66 
 
 
454 aa  348  1e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.72 
 
 
460 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  43.18 
 
 
451 aa  348  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  47.31 
 
 
472 aa  347  2e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.53 
 
 
468 aa  345  6e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.53 
 
 
495 aa  345  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.64 
 
 
468 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  44.04 
 
 
455 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.86 
 
 
457 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  44.6 
 
 
452 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  44.44 
 
 
448 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  43.88 
 
 
449 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  43.55 
 
 
450 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  44.27 
 
 
457 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  44.04 
 
 
444 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  43.78 
 
 
450 aa  339  7e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  44.22 
 
 
456 aa  339  7e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  43.41 
 
 
441 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  45.14 
 
 
434 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  43.58 
 
 
444 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  42.36 
 
 
448 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  44.47 
 
 
451 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.37 
 
 
455 aa  334  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.58 
 
 
452 aa  333  5e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  43.55 
 
 
450 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  42.83 
 
 
454 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.63 
 
 
450 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  43.94 
 
 
445 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  42.73 
 
 
441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  42.07 
 
 
439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.4 
 
 
439 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  45.01 
 
 
434 aa  326  5e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  43.95 
 
 
447 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  43.51 
 
 
442 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  39.21 
 
 
429 aa  324  2e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.53 
 
 
440 aa  323  3e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2364  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.72 
 
 
445 aa  323  4e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.25 
 
 
445 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  43.19 
 
 
455 aa  319  5e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  42.26 
 
 
444 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.61 
 
 
449 aa  317  2e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.2 
 
 
448 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  42.66 
 
 
450 aa  317  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  43.58 
 
 
445 aa  317  3e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.55 
 
 
441 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.96 
 
 
454 aa  316  5e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  42.13 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.8 
 
 
448 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  42.09 
 
 
431 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.09 
 
 
431 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  40.23 
 
 
440 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.67 
 
 
446 aa  312  9e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  41.86 
 
 
431 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  41.86 
 
 
431 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  41.86 
 
 
431 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  41.86 
 
 
431 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  41.76 
 
 
440 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.55 
 
 
441 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.8 
 
 
448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.63 
 
 
431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  41.51 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  44.82 
 
 
467 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.55 
 
 
441 aa  307  3e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  42.26 
 
 
461 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.31 
 
 
449 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  41.42 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.77 
 
 
445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.47 
 
 
445 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  41.86 
 
 
450 aa  302  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.56 
 
 
452 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  39.21 
 
 
1121 aa  300  3e-80  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5007  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  40.92 
 
 
442 aa  298  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.643407  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  40.05 
 
 
451 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  38.85 
 
 
449 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>