More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4356 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  100 
 
 
449 aa  891    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  50.45 
 
 
492 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  50 
 
 
454 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.88 
 
 
468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1181  nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.88 
 
 
468 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2448  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  50.88 
 
 
495 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  47.74 
 
 
451 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  49.66 
 
 
434 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  49.32 
 
 
469 aa  393  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5868  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  52.36 
 
 
445 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.478941  normal  0.0701056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.71 
 
 
455 aa  386  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  47.63 
 
 
451 aa  388  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  48.52 
 
 
458 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3782  nitrilotriacetate monooxygenase  45.72 
 
 
455 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  47.39 
 
 
450 aa  365  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.24 
 
 
459 aa  363  4e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  46.12 
 
 
447 aa  360  4e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  45.25 
 
 
449 aa  360  4e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  44.62 
 
 
431 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  44.62 
 
 
431 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  44.62 
 
 
431 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  44.62 
 
 
431 aa  354  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.62 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  44.62 
 
 
431 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  45.17 
 
 
442 aa  352  7e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2456  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.39 
 
 
431 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00745552  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0433  monooxygenase  46.65 
 
 
472 aa  351  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.744526  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  44.09 
 
 
448 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  45.12 
 
 
453 aa  347  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  45.33 
 
 
474 aa  346  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  44.19 
 
 
447 aa  341  2e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  44.72 
 
 
429 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2810  putative nitrilotriacetate monooxygenase  48.02 
 
 
429 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  42.12 
 
 
458 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  40.35 
 
 
454 aa  335  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  43.49 
 
 
452 aa  332  7.000000000000001e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  43.51 
 
 
436 aa  332  8e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6404  nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.87 
 
 
457 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0247936  normal  0.261136 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.56 
 
 
456 aa  331  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0251  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  42.44 
 
 
439 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.441756 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  42.41 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  42.6 
 
 
449 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  42.41 
 
 
458 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4521  monooxygenase-like protein  41.29 
 
 
455 aa  325  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  43.72 
 
 
447 aa  325  1e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  42.51 
 
 
453 aa  323  3e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  43.34 
 
 
457 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1773  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  42.76 
 
 
448 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.702307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1851  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.67 
 
 
452 aa  322  9.999999999999999e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  43.12 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.59 
 
 
441 aa  320  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  41.96 
 
 
445 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  42.66 
 
 
450 aa  320  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.51 
 
 
445 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5661  monooxygenase  43.85 
 
 
467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.394617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  42.89 
 
 
444 aa  318  9e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  41.18 
 
 
429 aa  317  2e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  42.66 
 
 
444 aa  318  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  41.97 
 
 
446 aa  315  7e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  43.18 
 
 
449 aa  315  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  42.4 
 
 
452 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21740  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  41.89 
 
 
442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.77772  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  41.16 
 
 
440 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  43.64 
 
 
445 aa  312  6.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  44.75 
 
 
454 aa  312  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.61 
 
 
460 aa  311  2e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.81 
 
 
457 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  41.52 
 
 
434 aa  310  5e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.91 
 
 
441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  42.34 
 
 
448 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4857  nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.07 
 
 
449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140464  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1908  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  41.57 
 
 
454 aa  305  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.504324  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4330  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  40.45 
 
 
457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  40.04 
 
 
448 aa  304  2.0000000000000002e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5298  Nrd protein  42.89 
 
 
461 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826228  normal  0.019429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0349  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  39.95 
 
 
441 aa  302  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2378  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  39.42 
 
 
440 aa  302  8.000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4938  putative monooxygenase  42.95 
 
 
451 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1544  luciferase-like protein  40.27 
 
 
449 aa  298  1e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.324822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  43.92 
 
 
444 aa  297  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5125  putative monooxygenase protein  42 
 
 
450 aa  296  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  40.94 
 
 
452 aa  295  8e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0118  putative monooxygenase  40.41 
 
 
445 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.83 
 
 
448 aa  293  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  42.14 
 
 
455 aa  292  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4737  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.13 
 
 
441 aa  291  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2176  nitrilotriacetate monooxygenase component A  40.63 
 
 
445 aa  291  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  40.95 
 
 
451 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6386  monooxygenase protein  39.43 
 
 
450 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0181294  normal  0.0362961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2425  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA family  39.01 
 
 
448 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.109543  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  39.33 
 
 
439 aa  290  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4542  putative monooxygenase protein  39.82 
 
 
450 aa  290  3e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0938197 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  41.31 
 
 
448 aa  290  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  39.91 
 
 
444 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2535  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  38.58 
 
 
444 aa  290  4e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.354477  normal  0.017296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0770  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  40.09 
 
 
450 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  39.86 
 
 
441 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2001  putative monooxygenase  39.73 
 
 
449 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1398  nitrilotriacetate monooxygenase  39.73 
 
 
449 aa  286  4e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.748154  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1311  putative monooxygenase  39.73 
 
 
449 aa  286  4e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>