29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4589 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  87.05 
 
 		 193 aa  354  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  67.88 
 
 		 195 aa  279  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  65.8 
 
 		 199 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  56.42 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  51.08 
 
 		 211 aa  172  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  50 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  51.3 
 
 		 191 aa  168  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  48.37 
 
 		 190 aa  155  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  26.9 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  30.08 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  27.5 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  31.58 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  30.87 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28.86 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  29.37 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.67 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1248  phosphoglycerate mutase  28.4 
 
 		 220 aa  44.7  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0990059  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.99 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  25 
 
 		 241 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  28.99 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  28.66 
 
 		 207 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  26.61 
 
 		 223 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  28.99 
 
 		 200 aa  42  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  25.47 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  27.08 
 
 		 220 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>