17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3544 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
237 aa  496  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  54.79 
 
 
191 aa  185  6e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
193 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  50 
 
 
193 aa  176  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  50.79 
 
 
195 aa  169  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  44.27 
 
 
211 aa  154  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  51.3 
 
 
244 aa  154  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  47.62 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  41.08 
 
 
190 aa  142  5e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  27.34 
 
 
202 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  25.7 
 
 
190 aa  48.9  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  25.52 
 
 
209 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  25.52 
 
 
212 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  26.24 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2451  phosphoglycerate mutase  26.63 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.590939  normal  0.0803681 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4680  phosphoglycerate mutase  23.65 
 
 
184 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  22.7 
 
 
197 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>