24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4326 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
193 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  87.05 
 
 
193 aa  354  5e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  66.32 
 
 
195 aa  275  3e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  63.21 
 
 
199 aa  242  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 
244 aa  176  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  50 
 
 
237 aa  170  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  49.48 
 
 
191 aa  164  5.9999999999999996e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  47.31 
 
 
211 aa  157  8e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  47.59 
 
 
190 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1977  Phosphoglycerate mutase  31.01 
 
 
190 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00635412  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  24.67 
 
 
241 aa  48.5  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  26.88 
 
 
223 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  31.21 
 
 
197 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.71 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  28 
 
 
209 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  28.26 
 
 
200 aa  46.2  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  29.71 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  29.71 
 
 
200 aa  44.7  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3348  Phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
223 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27148  hitchhiker  0.000518506 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  27.97 
 
 
200 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  28.77 
 
 
227 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  27.78 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  25.36 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  26.95 
 
 
220 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>