23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0356 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  56.42 
 
 
193 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  56.5 
 
 
193 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  55.03 
 
 
195 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  52.13 
 
 
199 aa  172  5.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  55.68 
 
 
191 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  51.3 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  46.45 
 
 
190 aa  155  7e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  48.85 
 
 
211 aa  148  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 
203 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 
202 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  28.57 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  37.84 
 
 
203 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  26.85 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  26.67 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  26.38 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3134  putative Alpha-ribazole phosphatase (anaerobic pathway of cobalamin biosynthesis, cobC)  30.95 
 
 
197 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.552809  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  26.23 
 
 
207 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
209 aa  42.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  28.08 
 
 
200 aa  42  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>