14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3541 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3541  phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 199 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0348  hypothetical protein  67.88 
 
 		 195 aa  271  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.236028  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4589  Phosphoglycerate mutase  65.8 
 
 		 193 aa  266  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4326  Phosphoglycerate mutase  63.21 
 
 		 193 aa  255  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2641  Phosphoglycerate mutase  47.87 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3524  phosphoglycerate mutase  50.53 
 
 		 191 aa  160  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0780  phosphoglycerate mutase  45.65 
 
 		 190 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0356  phosphoglycerate mutase  52.13 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111547  normal  0.767481 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3544  phosphoglycerate mutase  47.09 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.359428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  29.58 
 
 		 203 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  31.62 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  29.91 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>