17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4274 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  750    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  142  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  26.98 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  29.22 
 
 		 369 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  30.55 
 
 		 318 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  31.09 
 
 		 309 aa  126  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  28.52 
 
 		 351 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  27.76 
 
 		 331 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  115  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  26.07 
 
 		 339 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  25.71 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  23 
 
 		 376 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  25.54 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  26.29 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  24.36 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  26.87 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>