18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3731 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  621  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  49.2 
 
 
310 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  41.33 
 
 
294 aa  205  6e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  44.19 
 
 
294 aa  205  8e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  39.86 
 
 
318 aa  192  9e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  36.02 
 
 
339 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  36.02 
 
 
339 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  33.94 
 
 
369 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  34.36 
 
 
331 aa  155  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  32.44 
 
 
351 aa  128  9.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  32.23 
 
 
376 aa  127  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  31.09 
 
 
368 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  29.41 
 
 
425 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  34.78 
 
 
305 aa  114  3e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  25.1 
 
 
331 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  27.78 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  21.03 
 
 
355 aa  50.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0397  hypothetical protein  23.25 
 
 
342 aa  49.7  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000547863  hitchhiker  0.000221535 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>