15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2874 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  677    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  32.92 
 
 		 310 aa  136  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  28.57 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  26.36 
 
 		 331 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  25.58 
 
 		 339 aa  113  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  27.07 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  27.03 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  25.1 
 
 		 309 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  23.6 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  22.75 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  22.31 
 
 		 369 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  26.29 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  24.26 
 
 		 376 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  20.11 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>