16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4065 on replicon NC_008739
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  626  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  31.95 
 
 
318 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  30.08 
 
 
294 aa  116  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  34.78 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  30.08 
 
 
294 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  27.12 
 
 
425 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  27.23 
 
 
369 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  28.39 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  25 
 
 
331 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  25.54 
 
 
368 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  26.46 
 
 
339 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  26.01 
 
 
339 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  26.61 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  25.11 
 
 
376 aa  63.5  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  20.76 
 
 
351 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  20.11 
 
 
331 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>