13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1275 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  26.61 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  26.24 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  27.78 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  26.4 
 
 		 369 aa  67  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  23.72 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  25.91 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  25.61 
 
 		 294 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  22.71 
 
 		 339 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  22.34 
 
 		 339 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  26.87 
 
 		 368 aa  56.2  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  26.36 
 
 		 331 aa  53.1  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  21.82 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>