16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2160 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  45.24 
 
 		 294 aa  241  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  42.09 
 
 		 294 aa  239  5e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  37.08 
 
 		 331 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  40.77 
 
 		 309 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  182  8.000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  39.25 
 
 		 339 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  35.25 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  30.55 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  31.34 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  31.95 
 
 		 305 aa  122  6e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  29.75 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  31.23 
 
 		 376 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  29.28 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  27.03 
 
 		 331 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  21.91 
 
 		 303 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>