18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1889 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  100 
 
 
310 aa  630  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  48.88 
 
 
309 aa  275  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  43.41 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  43.02 
 
 
294 aa  196  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  35.06 
 
 
339 aa  178  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  35.39 
 
 
339 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  36.57 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  36.78 
 
 
318 aa  169  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  30.66 
 
 
369 aa  136  4e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  32.92 
 
 
331 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  30.48 
 
 
368 aa  115  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  29.05 
 
 
425 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  28.67 
 
 
351 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  30 
 
 
376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  28.39 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0397  hypothetical protein  24.63 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000547863  hitchhiker  0.000221535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1275  hypothetical protein  23.72 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  22.88 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>