13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6163 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6163  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  721    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0408502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0397  hypothetical protein  66.18 
 
 		 342 aa  378  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000547863  hitchhiker  0.000221535 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  22.88 
 
 		 310 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  24.36 
 
 		 368 aa  57.4  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  24.88 
 
 		 425 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  24.21 
 
 		 294 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  24.21 
 
 		 294 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  25.13 
 
 		 369 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  23.97 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  21.03 
 
 		 309 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  24.76 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  23.19 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  24.5 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>