15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5496 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5496  hypothetical protein  100 
 
 
351 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000328707  normal  0.790551 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4732  hypothetical protein  29.89 
 
 
369 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972118  normal  0.160192 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3434  hypothetical protein  29.82 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2921  hypothetical protein  29.47 
 
 
339 aa  133  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0264  hypothetical protein  31.94 
 
 
294 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0209  hypothetical protein  31.56 
 
 
294 aa  129  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3731  hypothetical protein  32.44 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2612  hypothetical protein  29.09 
 
 
331 aa  126  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.628877  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4274  hypothetical protein  28.52 
 
 
368 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2160  hypothetical protein  29.28 
 
 
318 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1889  hypothetical protein  28.67 
 
 
310 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.241565  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0111  hypothetical protein  26.98 
 
 
425 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.260276 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5216  hypothetical protein  26.32 
 
 
376 aa  97.8  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2874  hypothetical protein  23.6 
 
 
331 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0732457  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4065  hypothetical protein  20.76 
 
 
305 aa  48.5  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>