263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4178 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4178  putative 4-hydroxybutyrate-CoA transferase/hydrolase  100 
 
 
425 aa  852    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.400087  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5032  putative 4-hydroxybutyrate CoA transferase  37.93 
 
 
413 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6899  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.8 
 
 
423 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.27 
 
 
430 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0123  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.41 
 
 
441 aa  219  6e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0141  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.92 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.61 
 
 
415 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.599224  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.47 
 
 
433 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  32.67 
 
 
431 aa  192  1e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  35.48 
 
 
431 aa  191  2e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.78 
 
 
445 aa  186  8e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.78 
 
 
443 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.78 
 
 
443 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.78 
 
 
443 aa  186  9e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.47 
 
 
443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  36.17 
 
 
443 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.99 
 
 
430 aa  184  3e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.17 
 
 
443 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.17 
 
 
431 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.44 
 
 
437 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.54 
 
 
431 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.39 
 
 
433 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.48 
 
 
430 aa  177  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.25 
 
 
428 aa  176  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.33 
 
 
407 aa  176  6e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.73 
 
 
428 aa  176  7e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.38 
 
 
443 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  36.25 
 
 
615 aa  172  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1838  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.09 
 
 
427 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211027  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.11 
 
 
437 aa  171  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.04 
 
 
429 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.79 
 
 
428 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.36 
 
 
430 aa  170  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  36.7 
 
 
438 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.36 
 
 
432 aa  170  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.13 
 
 
428 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36 
 
 
442 aa  169  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.43 
 
 
479 aa  169  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.91 
 
 
634 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.37 
 
 
434 aa  167  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.45 
 
 
428 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.05 
 
 
424 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
428 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.71 
 
 
437 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.83 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.53 
 
 
427 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
428 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.57 
 
 
611 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.71 
 
 
437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.05 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.05 
 
 
424 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
428 aa  167  4e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.5 
 
 
428 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  31.78 
 
 
636 aa  167  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.3 
 
 
428 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.74 
 
 
420 aa  166  5.9999999999999996e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.18 
 
 
441 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.74 
 
 
617 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.81 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.81 
 
 
449 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2128  hypothetical protein  34.66 
 
 
448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.535079  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.81 
 
 
449 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.08 
 
 
616 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.81 
 
 
428 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.31 
 
 
432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.29 
 
 
614 aa  163  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.56 
 
 
455 aa  163  6e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.84 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.84 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.84 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.37 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.5 
 
 
428 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.51 
 
 
616 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.26 
 
 
432 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  35.47 
 
 
432 aa  161  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.46 
 
 
424 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.54 
 
 
441 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  30.11 
 
 
627 aa  160  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.39 
 
 
623 aa  158  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.39 
 
 
437 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.69 
 
 
437 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.5 
 
 
428 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.62 
 
 
453 aa  155  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.84 
 
 
444 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  32.57 
 
 
622 aa  154  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.75 
 
 
431 aa  153  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.44 
 
 
645 aa  153  5e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.26 
 
 
445 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34.33 
 
 
440 aa  151  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.2 
 
 
431 aa  150  3e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.15 
 
 
445 aa  151  3e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  34 
 
 
440 aa  150  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34 
 
 
440 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1350  acetyl-CoA hydrolase/transferase  31.12 
 
 
447 aa  149  9e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.335116  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  29.9 
 
 
634 aa  149  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.44 
 
 
447 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  33 
 
 
431 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.87 
 
 
447 aa  145  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.75 
 
 
448 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  28.99 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>