264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2054 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 
441 aa  923    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  85.94 
 
 
437 aa  811    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  74.6 
 
 
437 aa  712    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  77.32 
 
 
437 aa  723    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  76.19 
 
 
437 aa  737    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  85.03 
 
 
437 aa  803    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.47 
 
 
431 aa  459  9.999999999999999e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.39 
 
 
432 aa  460  9.999999999999999e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.03 
 
 
431 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.54 
 
 
431 aa  449  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.35 
 
 
428 aa  435  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.63 
 
 
431 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.2 
 
 
431 aa  362  5.0000000000000005e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44 
 
 
441 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.36 
 
 
453 aa  352  5.9999999999999994e-96  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  42.03 
 
 
431 aa  352  7e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  42.89 
 
 
431 aa  350  3e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.64 
 
 
445 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.64 
 
 
445 aa  346  6e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.13 
 
 
434 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.89 
 
 
627 aa  340  4e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.2 
 
 
455 aa  339  5.9999999999999996e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.14 
 
 
432 aa  339  7e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.68 
 
 
645 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  45.81 
 
 
615 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.49 
 
 
437 aa  335  1e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.73 
 
 
443 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.73 
 
 
443 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.73 
 
 
443 aa  334  2e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.73 
 
 
445 aa  333  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  42.51 
 
 
443 aa  332  9e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  42.28 
 
 
443 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  42.28 
 
 
443 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.57 
 
 
444 aa  331  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.08 
 
 
617 aa  329  7e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.83 
 
 
611 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.54 
 
 
614 aa  328  2.0000000000000001e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.14 
 
 
446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  39.07 
 
 
431 aa  326  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.38 
 
 
428 aa  326  6e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.65 
 
 
424 aa  323  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.85 
 
 
430 aa  323  4e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.15 
 
 
446 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  40.29 
 
 
622 aa  323  5e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.42 
 
 
424 aa  322  6e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.55 
 
 
440 aa  322  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.42 
 
 
424 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.56 
 
 
443 aa  321  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.55 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.32 
 
 
440 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.77 
 
 
427 aa  319  5e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.14 
 
 
424 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.62 
 
 
616 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  39.36 
 
 
432 aa  318  1e-85  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.16 
 
 
616 aa  317  2e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.81 
 
 
428 aa  315  9.999999999999999e-85  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.58 
 
 
430 aa  312  5.999999999999999e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.89 
 
 
636 aa  311  1e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.17 
 
 
441 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.17 
 
 
441 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.17 
 
 
441 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.17 
 
 
441 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.34 
 
 
432 aa  310  4e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.1 
 
 
634 aa  310  4e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.36 
 
 
433 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.67 
 
 
428 aa  309  8e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.24 
 
 
430 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.71 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.03 
 
 
429 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.53 
 
 
428 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.05 
 
 
479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.53 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.68 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.73 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.98 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  41.24 
 
 
445 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.81 
 
 
428 aa  300  4e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.5 
 
 
447 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  39.37 
 
 
449 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.57 
 
 
428 aa  296  5e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.77 
 
 
420 aa  296  6e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.49 
 
 
407 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.69 
 
 
448 aa  294  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.33 
 
 
428 aa  292  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.09 
 
 
428 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.33 
 
 
428 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.33 
 
 
428 aa  290  3e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.47 
 
 
432 aa  289  8e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.46 
 
 
442 aa  288  1e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  36.22 
 
 
438 aa  286  4e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.56 
 
 
623 aa  286  7e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.01 
 
 
447 aa  286  7e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.25 
 
 
445 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  38.12 
 
 
428 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  38.01 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.82 
 
 
447 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  38.12 
 
 
447 aa  279  6e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.17 
 
 
449 aa  278  2e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0577  4-hydroxybutyrate CoA transferase (cat2-1)  39.17 
 
 
444 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.537722  hitchhiker  0.000215809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.3 
 
 
446 aa  273  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>