263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2639 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  95.56 
 
 
428 aa  843    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 
428 aa  826    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  92.52 
 
 
428 aa  812    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 
428 aa  827    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  77.3 
 
 
428 aa  683    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  84.58 
 
 
428 aa  761    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  85.28 
 
 
428 aa  764    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 
428 aa  830    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  93.69 
 
 
428 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  99.55 
 
 
449 aa  917    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 
449 aa  920    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  83.18 
 
 
428 aa  743    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  99.3 
 
 
428 aa  870    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  57.79 
 
 
428 aa  478  1e-134  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.21 
 
 
430 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.58 
 
 
424 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.34 
 
 
424 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  54.07 
 
 
432 aa  464  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  54.78 
 
 
430 aa  464  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.11 
 
 
424 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  55.11 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.31 
 
 
428 aa  456  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.83 
 
 
429 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.9 
 
 
432 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.21 
 
 
428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.91 
 
 
427 aa  445  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.44 
 
 
430 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.55 
 
 
453 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.54 
 
 
431 aa  422  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.23 
 
 
455 aa  420  1e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  52.3 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.68 
 
 
420 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.24 
 
 
611 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.26 
 
 
616 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.37 
 
 
617 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.92 
 
 
616 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.71 
 
 
614 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.84 
 
 
434 aa  377  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.1 
 
 
443 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  45.01 
 
 
431 aa  373  1e-102  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  46.19 
 
 
622 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  46.44 
 
 
615 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.42 
 
 
445 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.73 
 
 
645 aa  371  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.18 
 
 
445 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.83 
 
 
627 aa  350  2e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.06 
 
 
634 aa  347  2e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.77 
 
 
636 aa  344  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.24 
 
 
428 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  41.75 
 
 
431 aa  340  2.9999999999999998e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.75 
 
 
623 aa  335  1e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.61 
 
 
437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.98 
 
 
431 aa  322  7e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.44 
 
 
437 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.08 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.67 
 
 
437 aa  315  7e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.71 
 
 
431 aa  311  2e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.56 
 
 
437 aa  310  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.08 
 
 
437 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.1 
 
 
431 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.68 
 
 
441 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.76 
 
 
634 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.28 
 
 
437 aa  295  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  40.68 
 
 
432 aa  293  3e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.59 
 
 
441 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.37 
 
 
443 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.37 
 
 
443 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.37 
 
 
443 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  38.59 
 
 
431 aa  289  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.11 
 
 
443 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.11 
 
 
443 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.11 
 
 
443 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  39.11 
 
 
445 aa  289  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.23 
 
 
444 aa  286  5e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.82 
 
 
446 aa  286  7e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.05 
 
 
432 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.72 
 
 
441 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.72 
 
 
441 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.72 
 
 
441 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.72 
 
 
441 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.15 
 
 
433 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.72 
 
 
479 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.57 
 
 
440 aa  272  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.57 
 
 
440 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.34 
 
 
440 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.95 
 
 
442 aa  271  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.38 
 
 
633 aa  270  4e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.29 
 
 
446 aa  270  5e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  38.1 
 
 
438 aa  267  4e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.87 
 
 
407 aa  265  1e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.94 
 
 
446 aa  265  2e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
447 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.17 
 
 
447 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.55 
 
 
449 aa  262  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.79 
 
 
445 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.61 
 
 
430 aa  256  6e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.26 
 
 
448 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.81 
 
 
447 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1350  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.89 
 
 
447 aa  249  5e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.335116  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1014  hypothetical protein  36.02 
 
 
447 aa  248  1e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>