More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1430 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  100 
 
 		 616 aa  1273    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  81.01 
 
 		 617 aa  1043    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  97.08 
 
 		 616 aa  1247    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  45.75 
 
 		 615 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.86 
 
 		 645 aa  516  1.0000000000000001e-145  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.67 
 
 		 611 aa  510  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.9 
 
 		 623 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  42.42 
 
 		 627 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  43.48 
 
 		 634 aa  506  9.999999999999999e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  44.44 
 
 		 622 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  44.84 
 
 		 614 aa  499  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.39 
 
 		 636 aa  495  1e-139  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.32 
 
 		 431 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  54.27 
 
 		 431 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.54 
 
 		 634 aa  457  1e-127  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  52.55 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.97 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.84 
 
 		 424 aa  419  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  46.92 
 
 		 431 aa  416  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.36 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  50.71 
 
 		 432 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.36 
 
 		 424 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.05 
 
 		 453 aa  419  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  50.85 
 
 		 428 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.52 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.29 
 
 		 430 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.27 
 
 		 427 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  51.7 
 
 		 424 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.75 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  49.27 
 
 		 429 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.7 
 
 		 430 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.54 
 
 		 445 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.31 
 
 		 445 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.63 
 
 		 633 aa  398  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.32 
 
 		 434 aa  395  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  48.17 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.29 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.03 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.41 
 
 		 428 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.17 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.17 
 
 		 428 aa  389  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.17 
 
 		 428 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.46 
 
 		 432 aa  386  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.17 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  46.4 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.92 
 
 		 428 aa  387  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.92 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  47.92 
 
 		 449 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  48.79 
 
 		 428 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.77 
 
 		 428 aa  384  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  45.87 
 
 		 420 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  47.56 
 
 		 428 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  41.59 
 
 		 431 aa  353  7e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.09 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.91 
 
 		 431 aa  340  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.19 
 
 		 437 aa  340  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.6 
 
 		 432 aa  335  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.63 
 
 		 437 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  39.91 
 
 		 431 aa  327  5e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.39 
 
 		 437 aa  326  7e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.65 
 
 		 432 aa  325  1e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.72 
 
 		 431 aa  324  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.37 
 
 		 437 aa  319  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.16 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.49 
 
 		 441 aa  316  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.09 
 
 		 431 aa  301  3e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2025  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.85 
 
 		 449 aa  300  6e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000691604  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.44 
 
 		 437 aa  298  3e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1579  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.83 
 
 		 433 aa  295  1e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  36.09 
 
 		 432 aa  295  1e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.27 
 
 		 442 aa  293  5e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0436  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.77 
 
 		 446 aa  286  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  34.98 
 
 		 438 aa  283  5.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1744  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.5 
 
 		 444 aa  283  6.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.91 
 
 		 407 aa  280  6e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.83 
 
 		 446 aa  280  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.33 
 
 		 479 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.99 
 
 		 446 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.79 
 
 		 440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  36.57 
 
 		 440 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2137  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.61 
 
 		 445 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.758838  normal  0.0258609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.34 
 
 		 440 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1489  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.86 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.59 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.59 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.59 
 
 		 443 aa  270  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1014  hypothetical protein  36.26 
 
 		 447 aa  271  4e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.81 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.81 
 
 		 443 aa  270  5e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  35.59 
 
 		 445 aa  270  5e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  35.59 
 
 		 443 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1147  hypothetical protein  38.28 
 
 		 449 aa  269  1e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0352  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.16 
 
 		 447 aa  267  4e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4529  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36 
 
 		 446 aa  266  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  36.55 
 
 		 445 aa  259  7e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0309  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.35 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1932  hypothetical protein  34 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2267  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.68 
 
 		 448 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0630607  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0787  hypothetical protein  35.35 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.65 
 
 		 430 aa  254  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>