More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1258 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_1258  transferase hexapeptide protein  100 
 
 
167 aa  335  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137738  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1624  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.85 
 
 
196 aa  145  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.382008  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2880  putative lipopolysaccharide biosynthesis O-acetyl transferase WbbJ  41.03 
 
 
176 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1411  hexapaptide repeat-containing transferase  38.06 
 
 
192 aa  93.6  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.02096 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3095  hexapaptide repeat-containing transferase  41.01 
 
 
239 aa  90.1  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.165073 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2895  putative acetyltransferase  35.76 
 
 
198 aa  87  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2883  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  36.54 
 
 
199 aa  85.9  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1408  acetyltransferase  37.98 
 
 
203 aa  80.9  0.000000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0573867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1611  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.38 
 
 
200 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.852212  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0883  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  34.59 
 
 
163 aa  80.9  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00414991  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2268  hypothetical protein  36.36 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511074 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1976  galactoside O-acetyltransferase  37.4 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3187  hexapaptide repeat-containing transferase  27.54 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0959  hexapaptide repeat-containing transferase  37.78 
 
 
267 aa  75.1  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.642505  normal  0.321102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4847  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  37.96 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1961  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  39.45 
 
 
214 aa  74.7  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.11607  hitchhiker  0.0000808015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3249  acetyltransferase  30.63 
 
 
221 aa  73.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2294  hexapaptide repeat-containing transferase  36.13 
 
 
187 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0503645  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2366  maltose O-acetyltransferase  36.97 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00399682  normal  0.268659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2484  hexapaptide repeat-containing transferase  35.77 
 
 
185 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.754666 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28390  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  32.89 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4918  hexapaptide repeat-containing transferase  43.43 
 
 
191 aa  73.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.198536  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1843  acetyltransferase  29.19 
 
 
222 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1969  putative O-acetyl transferase (O-antigen-related)  36.21 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.735185  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0578  putative acetyltransferase  36.21 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.530217  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0671  galactoside O-acetyltransferase  36.21 
 
 
189 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2631  hexapaptide repeat-containing transferase  33.06 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.778978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2577  hexapaptide repeat-containing transferase  33.06 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2989  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.8 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00224125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2668  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.81 
 
 
182 aa  71.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.104139 
 
 
-
 
NC_003296  RS02346  putative acyl transferase protein  39.17 
 
 
170 aa  71.2  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.876426  normal  0.444308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2869  nodulation protein L, putative  35.26 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2961  nodulation protein L, putative  35.26 
 
 
207 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1203  hexapaptide repeat-containing transferase  34.69 
 
 
200 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.614954  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2095  hexapaptide repeat-containing transferase  30.07 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3784  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.5 
 
 
181 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000385  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.78 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01960  predicted acyl transferase  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1603  transferase hexapeptide repeat containing protein  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.501226  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1961  maltose O-acetyltransferase  36.36 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1587  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01949  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4264  hypothetical protein  30.72 
 
 
274 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1178  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1730  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.29 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00404551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0562  putative acetyltransferase  31.51 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0007487  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1463  hexapaptide repeat-containing transferase  35.77 
 
 
192 aa  69.3  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000251809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2347  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  29.03 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2617  hexapaptide repeat-containing transferase  35.29 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6061  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  30.97 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06920  hypothetical protein  33.87 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.832713  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2730  hexapaptide repeat-containing transferase  34.45 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.375886 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2162  maltose O-acetyltransferase  53.97 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.225842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1398  hexapaptide repeat-containing transferase  40.34 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.453151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1008  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  28.48 
 
 
182 aa  68.9  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0758  acetyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.708622  normal  0.0152344 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0055  transferase hexapeptide repeat containing protein  33.1 
 
 
165 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.463535 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1974  hypothetical protein  33.05 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.931779  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3715  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)-like protein  31.88 
 
 
209 aa  67.8  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.780244  normal  0.0511861 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0373  galactoside O-acetyltransferase  31.14 
 
 
206 aa  67.8  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12060  acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)  38.14 
 
 
193 aa  67.8  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0832  Isoleucine patch superfamily acetyltransferase  38.61 
 
 
223 aa  67.8  0.00000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00296  galactoside O-acetyltransferase  32.28 
 
 
203 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.21865  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4095  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  29.49 
 
 
182 aa  67.4  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.977021 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00300  hypothetical protein  32.28 
 
 
203 aa  67.4  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.279411  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3264  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.28 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2655  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.45 
 
 
194 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3283  galactoside O-acetyltransferase  32.28 
 
 
201 aa  67.4  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.142249  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0739  transferase hexapeptide repeat containing protein  30.97 
 
 
200 aa  67.4  0.00000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.597159 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3219  hexapaptide repeat-containing transferase  33.61 
 
 
268 aa  67  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.282397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0415  galactoside O-acetyltransferase  31.55 
 
 
203 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2197  putative sugar acetyltransferase  29.52 
 
 
220 aa  67  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4496  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  32.5 
 
 
212 aa  66.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6269  putative acetyltransferase  29.19 
 
 
213 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.501907  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3668  hexapaptide repeat-containing transferase  35.48 
 
 
186 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2336  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.63 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.556666 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1864  putative transferase  28.28 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1584  hexapaptide repeat-containing transferase  33.11 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2235  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  30.63 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.778801  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4339  hypothetical protein  33.87 
 
 
206 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.257588  normal  0.0431137 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1911  putative transferase  28.28 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2637  hexapaptide repeat-containing transferase  32.47 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.94707 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1845  putative transferase  28.28 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.713416 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5031  Maltose O-acetyltransferase  36.97 
 
 
183 aa  65.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1896  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.47 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1731  galactoside O-acetyltransferase  31.75 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.142359  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2849  putative acetyltransferase  34.19 
 
 
187 aa  65.1  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2450  putative colanic acid biosynthesis acetyltransferase WcaF  31.33 
 
 
184 aa  64.7  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal  0.0117198 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02207  hypothetical protein  34.48 
 
 
206 aa  65.1  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3508  nodulation protein L  28.35 
 
 
181 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0002287  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4185  hexapaptide repeat-containing transferase  39.13 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1439  hexapaptide repeat-containing transferase  35.21 
 
 
218 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3430  Acetyltransferase (isoleucine patch superfamily)- like protein  45.36 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2881  putative acetyltransferase  35.71 
 
 
206 aa  64.7  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2531  hexapaptide repeat-containing transferase  53.57 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0941217  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4911  maltose O-acetyltransferase  37.82 
 
 
183 aa  64.7  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4862  transferase hexapeptide repeat containing protein  38.79 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.290079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1504  maltose O-acetyltransferase  35.29 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0449788  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05770  hypothetical protein  38.32 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2373  transferase hexapeptide repeat containing protein  35.9 
 
 
180 aa  64.3  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>