15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4149 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  268  2e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  38.74 
 
 
107 aa  79.3  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  37.01 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  39.13 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  39.25 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  40.54 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  39.02 
 
 
185 aa  67.8  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  36.28 
 
 
128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  40.54 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  36.29 
 
 
129 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  35.45 
 
 
313 aa  62  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  34.96 
 
 
131 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  35.19 
 
 
113 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  34.15 
 
 
105 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  28.99 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>