15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0262 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  278  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  79.2 
 
 
128 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  59.6 
 
 
111 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  50.98 
 
 
111 aa  112  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  54.55 
 
 
111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  47.47 
 
 
118 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  46.08 
 
 
107 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  47.27 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  41.32 
 
 
185 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  46.34 
 
 
105 aa  80.1  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  37.19 
 
 
129 aa  78.6  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  39.62 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  39.25 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  47.54 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  31.13 
 
 
313 aa  57  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>