15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4973 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  268  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  73.23 
 
 		 185 aa  191  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  42.62 
 
 		 111 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  43.1 
 
 		 111 aa  94  6e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  47.27 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  42.24 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  43.97 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  40.71 
 
 		 107 aa  86.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  38.46 
 
 		 118 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  33.61 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  35.83 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  39.47 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  34.96 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  27.5 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  34.72 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>