15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4940 on replicon NC_009508
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  379  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  73.23 
 
 		 131 aa  191  5e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  49.14 
 
 		 111 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  43.1 
 
 		 107 aa  88.6  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  43.1 
 
 		 111 aa  87.8  8e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  41.32 
 
 		 137 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  43.1 
 
 		 128 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  44.83 
 
 		 111 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  40.52 
 
 		 118 aa  80.5  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  36.5 
 
 		 135 aa  72  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  39.02 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  35.11 
 
 		 129 aa  67  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  32.76 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  38.89 
 
 		 105 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  35.29 
 
 		 113 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>