15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0760 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_0760  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0123215  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0262  hypothetical protein  79.2 
 
 
137 aa  182  9e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3703  hypothetical protein  52.38 
 
 
111 aa  111  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0324  hypothetical protein  50.98 
 
 
111 aa  110  8.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4321  hypothetical protein  47.06 
 
 
118 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.10491  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3981  hypothetical protein  48.57 
 
 
111 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1220  hypothetical protein  44.76 
 
 
107 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4973  hypothetical protein  43.97 
 
 
131 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4940  hypothetical protein  43.1 
 
 
185 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110846  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4219  hypothetical protein  42.68 
 
 
105 aa  72.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4149  hypothetical protein  36.28 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0348915  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4016  hypothetical protein  34.75 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.392581  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2755  hypothetical protein  36.27 
 
 
313 aa  61.6  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18262  normal  0.916692 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3474  hypothetical protein  34.29 
 
 
113 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3941  hypothetical protein  32.5 
 
 
135 aa  55.5  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>